5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'- O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fósforoMidita

5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fosforamidita é o monômero padrão para a introdução de resíduos de 5-metil-2'-desoxicitidina em DNA sintético e oligonucleotídeos antisense. O grupo N4‑benzoíla protege a amina exocíclica da base citosina, evitando reações de ramificação durante a síntese em fase sólida. O grupo 5-metil no anel citosina aumenta a estabilidade térmica de duplexes formados com DNA ou RNA complementar (ΔTm ≈ +0,5–1,0°C por modificação) e, mais importante, reduz o potencial imunoestimulante de motivos CpG quando usados ​​em vacinas antisense ou baseadas em CpG. 5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fosforamidita é totalmente compatível com ciclos de síntese de DNA padrão (tempo de acoplamento 2–3 minutos, ativador como tetrazol ou DCI) e condições de desproteção padrão (NH₃ concentrado, 55°C, 8–16 horas). 5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fosforamidita também é um intermediário chave na síntese de oligonucleotídeos contendo ácido nucleico bloqueado (LNA) quando combinado com outros monômeros modificados. Esta fosforamidita é frequentemente usada na fabricação de medicamentos antisense aprovados pela FDA e em aplicações de pesquisa que exploram a regulação epigenética e a análise de metilação do DNA.

Parâmetros do produto

Garantia de qualidade na Cosperpharm

Cada lote passa por:

● Cromatografia gasosa (GC) – pureza ≥97,0%

● Titulação não aquosa – pureza ≥97,0%

● Índice de refração – análise confirmatória

● ¹H NMR – verificação estrutural

● Aparência – líquido transparente incolor a amarelo claro a laranja claro

Um COA abrangente, MSDS (com informações completas do GHS) e certificado de origem acompanham cada remessa.

Condições de armazenamento

Armazene 5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fosforamidita em um recipiente hermeticamente fechado sob atmosfera inerte (nitrogênio ou argônio) a –20°C para armazenamento de longo prazo. O armazenamento de curto prazo (até 3 meses) a 2–8°C sob dessecação pode ser aceitável, mas não é recomendado por períodos prolongados. Manter o recipiente seco, protegido da luz e longe de agentes oxidantes fortes e ácidos. O composto é altamente sensível à umidade; abrir somente sob condições anidras (porta-luvas ou com purga de argônio). Após a abertura, devolver o material não utilizado a –20°C imediatamente sob argônio.

Prazo de validade: 2–3 anos quando armazenado a –20°C em recipiente selado, purgado e inerte com dessecante.

Precauções de manuseio: Usar em capela. Use luvas de nitrila, óculos de segurança e jaleco. Evite gerar poeira. Lave as mãos após o manuseio. Consulte a SDS para obter informações completas de segurança.

Vantagens do produto

1. 5-Metilcitosina para maior estabilidade duplex e resistência à nuclease

O grupo 5-metil na base da citosina aumenta a temperatura de fusão (Tm) dos duplexes DNA/DNA e DNA/RNA em aproximadamente 0,5–1,0°C por modificação. Esta estabilização térmica é particularmente valiosa em oligonucleótidos anti-sentido, onde uma maior afinidade de ligação se traduz numa potência melhorada e numa dose necessária reduzida. O grupo metila também confere maior resistência a certas nucleases.

2. Imunoestimulação reduzida de motivos CpG

Os dinucleotídeos CpG não metilados são reconhecidos pelo receptor Toll-like 9 (TLR9) nas células do sistema imunológico humano, levando a efeitos imunoestimulantes indesejados. A incorporação de 5-metilcitosina em motivos CpG (convertendo CpG em 5-meCpG) elimina o reconhecimento de TLR9, reduzindo a liberação de citocinas fora do alvo em aplicações antisense e siRNA. A 5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fosforamidita permite esta imunomodulação crítica.

3. Compatibilidade total com síntese e desproteção de DNA padrão

5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fosforamidita usa o mesmo esquema de grupo protetor da 2′-desoxicitidina fosforamidita padrão (DMT em 5′, Bz em N4, CE em 3′), com a única diferença sendo o substituinte 5-metil. Portanto, não são necessárias alterações nos ciclos de síntese, nas soluções ativadoras ou nas condições de desproteção — ele funciona perfeitamente em todos os sintetizadores de DNA padrão.

4. Essencial para estudos de metilação da Ilha CpG

Na investigação epigenética, oligonucleótidos com padrões definidos de 5-metilcitosina são utilizados como substratos para metiltransferases, como padrões para sequenciação de bissulfito e como sondas para proteínas de ligação a metilo. 5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fosforamidita permite aos pesquisadores sintetizar sequências de DNA metiladas personalizadas sem metilação enzimática, o que muitas vezes produz padrões incompletos ou heterogêneos.

5. Terapêutica de oligonucleotídeos antisense

Vários medicamentos antisense aprovados pela FDA (por exemplo, nusinersen, inotersen) incorporam resíduos de 5-metilcitosina para aumentar a estabilidade e reduzir a imunogenicidade. 5'-O-(4,4'-DiMetoxitritil)-N4-benzoil-2'-desoxi-5-Metilcitidina-3'-O-(O-2-cianoetil-N,N-diisopropilaMino) fosforamidita é o monômero de escolha para a fabricação de tais produtos terapêuticos em escala comercial.

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