Fosforamidita Bz-rC

Bz-rC Fosforamidita é um monômero fundamental para a síntese química de oligonucleotídeos de RNA. O grupo protetor N4-benzoíla na base da citosina evita a ramificação e a terminação da cadeia durante o ciclo de acoplamento da fosforamidita, enquanto o grupo 2'-O-TBDMS protege a 2'-hidroxila durante a montagem da cadeia e é removido após a síntese usando reagentes à base de flúor, como o trihidrofluoreto de trietilamina (TEA·3HF). Bz-rC Phosphoramidita é compatível com protocolos padrão de síntese de RNA em sintetizadores automatizados de DNA/RNA (por exemplo, Applied Biosystems, MerMade, Dr. Oligo), normalmente usando soluções ativadoras de 0,25 M (5-etiltio-1H-tetrazol, 4,5-dicianoimidazol) e tempos de acoplamento de 5 a 10 minutos. A fosforamidita Bz-rC foi extensivamente validada na síntese de RNA para estudos estruturais, oligonucleotídeos antisense, siRNA e aptâmeros. A Fosforamidita Bz-rC também é usada como padrão de referência no perfil de impurezas de oligonucleotídeos, pois o grupo benzoíla pode dar origem a subprodutos característicos (por exemplo, produtos de N4-benzoil-depirimidinação) que devem ser monitorados durante o desenvolvimento do processo.

Parâmetros do produto

Garantia de qualidade na Cosperpharm

Cada lote passa por:

● Cromatografia gasosa (GC) – pureza ≥97,0%

● Titulação não aquosa – pureza ≥97,0%

● Índice de refração – análise confirmatória

● ¹H NMR – verificação estrutural

● Aparência – líquido transparente incolor a amarelo claro a laranja claro

Um COA abrangente, MSDS (com informações completas do GHS) e certificado de origem acompanham cada remessa.

Perguntas frequentes

Q1: Qual é a diferença entre a fosforamidita Bz-rC e a fosforamidita Ac-rC?

R: A Fosforamidita Bz-rC usa um grupo protetor de benzoíla (Bz) na amina exocíclica N4 da citosina, enquanto Ac-rC usa um grupo acetil (Ac). O grupo benzoíla proporciona maior proteção contra a depirimidinação sob condições ácidas de remoção de DMT (3% de ácido tricloroacético em diclorometano). Para a maioria das aplicações de síntese de RNA, o grupo benzoíla é preferido para sequências longas ou ricas em desoxicitidina.

Q2: Qual é o tempo de acoplamento recomendado para Fosforamidita Bz-rC em um sintetizador padrão?

R: Sob condições padrão de síntese de RNA com ativador 0,25 M (por exemplo, 5-etiltio-1H-tetrazol ou 4,5-dicianoimidazol), um tempo de acoplamento de 5 a 10 minutos é típico para Bz-rC Fosforamidita. Para oligonucleotídeos mais longos (>40 meros) ou síntese de alto rendimento, a otimização da concentração do ativador e do tempo de acoplamento pode melhorar os rendimentos.

Cenários de aplicação de produto

1. Síntese de Oligonucleotídeos de RNA

Bz-rC Fosforamidita é o bloco de construção padrão para a introdução de resíduos de citidina em oligonucleotídeos de RNA sintéticos para pesquisa, diagnóstico e desenvolvimento terapêutico.

2. Fabricação de siRNA

Usado para incorporar 2'-OH citidina em duplexes de siRNA. O grupo TBDMS é removido após a síntese, produzindo RNA totalmente nativo para estudos de RNAi.

3.Síntese de Oligonucleotídeo Antisense (ASO)

ASOs direcionados a transcritos de RNA requerem segmentos de RNA (por exemplo, em projetos de gapmer). Bz-rC Fosforamidita fornece os resíduos de citidina necessários com resistência total à nuclease quando deixado como 2'-OH ou modificado.

4. Geração de Aptâmero de RNA

Bibliotecas de aptâmeros e candidatos a aptâmeros individuais são sintetizados quimicamente usando Fosforamidita Bz-rC para garantir fidelidade e escalabilidade de sequência.

5. Preparação de RNA de biologia estrutural

Para estudos de cristalografia de raios X e RMN, sequências de RNA bem definidas devem ser sintetizadas com alta pureza. Bz-rC Phosphoramidite oferece a eficiência de acoplamento necessária e a limpeza de desproteção.

6.Padrão de Referência de Perfil de Impureza

Como uma potencial impureza de processo em substâncias medicamentosas oligonucleotídicas (por exemplo, N4-benzoil-citidina residual, produtos de desproteção incompleta), a Fosforamidita Bz-rC ou seus derivados desprotegidos servem como padrões de referência em métodos de HPLC e LC-MS.

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