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Z-Trp (Boc) -OH.DCHA (sal de diciclohexilamônio Nα-Z-Nᶦⁿ-Boc-L-triptofano) é um derivado de L-triptofano duplamente protegido apresentando dois grupos protetores ortogonais. A molécula consiste em um núcleo de L-triptofano com um grupo carbobenzoxi (Z) protegendo a funcionalidade α-amino e um grupo terc-butiloxicarbonil (Boc) protegendo o nitrogênio da cadeia lateral do indol.

Boc-D-Phe-OH (N-α-tert-Butoxicarbonil-D-fenilalanina) é um derivado protegido da D-fenilalanina apresentando um grupo terc-butiloxicarbonil (Boc) ligado à funcionalidade α-amino. A molécula consiste em um núcleo de fenilalanina com configuração D – um aminoácido quiral com uma cadeia lateral benzil – com o grupo protetor Boc protegendo o grupo amino de reações colaterais indesejadas.

GS-650804/Boc-(S)-ciclopropilglicina (ácido N-[(1,1-dimetiletoxi)carbonil]-(S)-amino-ciclopropilacético) é um aminoácido não natural protegido por Boc apresentando um grupo ciclopropil no carbono α da estrutura de glicina. Este motivo estrutural único combina o anel ciclopropil estericamente restrito com a quiralidade da configuração (S), criando um análogo de aminoácido conformacionalmente bloqueado que é altamente valorizado na química medicinal e na pesquisa de peptídeos.

Boc-His (Trt) -Ala-OH (N-[(1,1-dimetiletoxi)carbonil]-1-(trifenilmetil)-L-histidil-L-alanina) é um bloco de construção dipeptídeo protegido apresentando um resíduo de histidina protegido por Boc no terminal N com um grupo tritil (Trt) na cadeia lateral do imidazol, acoplado a um resíduo de alanina no terminal C.

Pal-Lys(Boc)-OH (N-[(1,1-dimetiletoxi)carbonil]-L-lisina éster palmitoil) é um derivado de aminoácido especializado apresentando uma estrutura de lisina com modificações duplas: um grupo protetor terc-butiloxicarbonil (Boc) na funcionalidade α-amino e um grupo éster palmitoil (hexadecanoil) na cadeia lateral carboxil.

HD-Lys(Boc)-NH2 (N⁶-(tert-Butoxicarbonil)-D-lisina amida) é um derivado de D-lisina de enantiômero único ortogonalmente protegido. Com fórmula molecular C₁₁H₂₃N₃O₃ e peso molecular de 245,32 g/mol, este composto apresenta uma arquitetura molecular que consiste em um grupo α-amino livre, uma carboxamida C-terminal e uma cadeia lateral ε-amino protegida por terc-butoxicarbonil (Boc).