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Boc-Pro-NH₂ (N-(terc-butoxicarbonil)-L-prolinamida, CAS 35150-07-3) é um derivado de L-prolina protegido por Boc apresentando uma amida primária na posição C2. A molécula consiste em um anel pirrolidina com um grupo terc-butiloxicarbonil (Boc) protegendo o nitrogênio do anel e um grupo carboxamida (-CONH2) no estereocentro C2.

Fmoc-Lys (C16-OtBu) -OH (CAS 2952671-06-4) é um derivado de lisina protegido por Fmoc especializado apresentando uma porção lipídica C16 de cadeia longa (grupo hexadecanoil / palmitoil) ligada ao grupo ε-amino da lisina por meio de uma ligação amida, com o ácido carboxílico C-terminal protegido como um éster terc-butílico. Esta arquitetura molecular única combina a funcionalidade α-amino protegida por Fmoc necessária para a síntese de peptídeos em fase sólida com uma cadeia alquil C16 lipofílica que confere propriedades anfifílicas aos peptídeos resultantes.

Fmoc-D-Trp-OH (Nα-Fmoc-D-triptofano, CAS 86123-11-7) é um derivado protegido por Fmoc do enantiômero D do triptofano, um aminoácido aromático essencial. A molécula apresenta o grupo 9-fluorenilmetoxicarbonil (Fmoc) protegendo a função α-amino, enquanto o ácido carboxílico permanece livre para o alongamento da cadeia peptídica. A cadeia lateral indol do Fmoc-D-Trp-OH fornece caráter aromático e capacidade de ligação de hidrogênio, tornando este composto um valioso bloco de construção para incorporar resíduos de D-triptofano em sequências peptídicas por meio da síntese de peptídeos em fase sólida Fmoc (SPPS).

Fmoc-beta-Ala-OH (Fmoc-β-alanina, ácido 3-((((9H-Fluoren-9-il)metoxi)carbonil)amino)propanóico, CAS 35737-10-1) é um derivado de β-aminoácido protegido por Fmoc apresentando o grupo protetor Fmoc (9-fluorenilmetiloxicarbonil) ligado ao grupo β-amino. Ao contrário dos α-aminoácidos padrão, o Fmoc-beta-Ala-OH contém o grupo amino na posição β (carbono 3) em relação ao ácido carboxílico, resultando em uma estrutura de três carbonos (H₂N-CH₂-CH₂-COOH) em vez da estrutura de dois carbonos da α-alanina.

Fmoc-Gln (Trt) -OH (Nα-Fmoc-Nδ-tritil-L-glutamina, CAS 132327-80-1) é um derivado de L-glutamina duplamente protegido apresentando o grupo protetor Fmoc (9-fluorenilmetiloxicarbonil) no grupo Nα-amino e o grupo protetor tritil (Trt, trifenilmetil) na amida da cadeia lateral Nδ. Esta estratégia única de proteção dupla aborda eficazmente os desafios inerentes à incorporação de glutamina na síntese de peptídeos.

Fmoc-7-Me-Trp-OH (N-Fmoc-7-metil-L-triptofano, CAS 1808268-53-2) é um derivado de aminoácido não proteinogênico protegido por Fmoc apresentando uma substituição 7-metil no anel indol do L-triptofano. A estrutura molecular consiste no grupo protetor fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) ligado ao grupo α-amino através de uma ligação carbamato, com um núcleo 7-metil-L-triptofano contendo um ácido carboxílico no terminal C.