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Fmoc-Pro-Pro-OH (N-fluorenilmetoxicarbonil-L-prolil-L-prolina) é um dipeptídeo protegido por Fmoc composto por dois resíduos de L-prolina ligados através de uma ligação peptídica. A molécula apresenta o grupo 9-fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) lábil ao ácido protegendo o terminal N, enquanto o ácido carboxílico C-terminal permanece livre para reações de acoplamento. A presença de dois resíduos de prolina consecutivos confere rigidez conformacional significativa à estrutura peptídica devido à estrutura única do anel de pirrolidina cíclica da prolina, que restringe a flexibilidade da estrutura e promove a formação de estruturas secundárias helicoidais e giratórias.

Fmoc-Phe (4-tBu) -OH (Fmoc-4-tert-butil-L-fenilalanina, CAS 213383-02-9) é um derivado de aminoácido aromático protegido por fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) empregado como um bloco de construção na síntese de peptídeos em fase sólida. A molécula apresenta um grupo 9-fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) protegendo a funcionalidade α-amino e um substituinte 4-terc-butil volumoso no anel fenil da cadeia lateral da fenilalanina.

Fmoc-beta-HGlu (OtBu) -OH (éster 6-terc-butílico do ácido Fmoc-L-β-homoglutâmico, CAS 203854-49-3) é um derivado de β-aminoácido especializado projetado para síntese de peptídeos em fase sólida Fmoc / t-Bu. A molécula apresenta um grupo protetor 9-fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) na função amino e um éster terc-butílico protegendo a função carboxila da cadeia lateral na posição 6. A estrutura do ácido β-homoglutâmico estende a cadeia peptídica em um átomo de carbono em comparação com o ácido glutâmico padrão, proporcionando propriedades conformacionais e funcionais únicas.

Fmoc-Dap (Boc) -OH (ácido Nα-Fmoc-Nβ-Boc-L-2,3-diaminopropiônico, CAS 162558-25-0) é um derivado de aminoácido não proteinogênico quiral protegido ortogonalmente classificado como um bloco de construção do ácido L-2,3-diaminopropiônico (Dap). A molécula apresenta um grupo protetor terc-butoxicarbonil (Boc) lábil a ácidos na funcionalidade β-amino da cadeia lateral e um grupo 9-fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) lábil a bases na posição α-amino.

Fmoc-Trp-OH (Nα-Fmoc-L-triptofano, CAS 35737-15-6) é um derivado protegido por Fmoc do aminoácido aromático de ocorrência natural L-triptofano. A estrutura molecular do Fmoc-Trp-OH consiste em uma estrutura de triptofano com um grupo protetor Fmoc (9-fluorenilmetoxicarbonil) ligado ao grupo α-amino. O triptofano é único entre os aminoácidos proteinogênicos por sua cadeia lateral indol – um sistema aromático bicíclico contendo um anel pirrol fundido a um anel benzênico.

Fmoc-Gln-OH (Nα-Fmoc-L-glutamina, CAS 71989-20-3) é um derivado protegido por Fmoc do aminoácido natural L-glutamina. A estrutura molecular do Fmoc-Gln-OH consiste em uma estrutura de glutamina contendo um grupo protetor Fmoc (9-fluorenilmetoxicarbonil) ligado ao grupo α-amino. O grupo Fmoc é uma porção protetora lábil em bases que é removida seletivamente sob condições básicas suaves (tipicamente piperidina em DMF), permitindo estratégias de desproteção ortogonais na síntese de peptídeos em fase sólida (SPPS).