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Fmoc-Dap (Boc) -OH (ácido Nα-Fmoc-Nβ-Boc-L-2,3-diaminopropiônico, CAS 162558-25-0) é um derivado de aminoácido não proteinogênico quiral protegido ortogonalmente classificado como um bloco de construção do ácido L-2,3-diaminopropiônico (Dap). A molécula apresenta um grupo protetor terc-butoxicarbonil (Boc) lábil a ácidos na funcionalidade β-amino da cadeia lateral e um grupo 9-fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) lábil a bases na posição α-amino.

Fmoc-Trp-OH (Nα-Fmoc-L-triptofano, CAS 35737-15-6) é um derivado protegido por Fmoc do aminoácido aromático de ocorrência natural L-triptofano. A estrutura molecular do Fmoc-Trp-OH consiste em uma estrutura de triptofano com um grupo protetor Fmoc (9-fluorenilmetoxicarbonil) ligado ao grupo α-amino. O triptofano é único entre os aminoácidos proteinogênicos por sua cadeia lateral indol – um sistema aromático bicíclico contendo um anel pirrol fundido a um anel benzênico.

Fmoc-Gln-OH (Nα-Fmoc-L-glutamina, CAS 71989-20-3) é um derivado protegido por Fmoc do aminoácido natural L-glutamina. A estrutura molecular do Fmoc-Gln-OH consiste em uma estrutura de glutamina contendo um grupo protetor Fmoc (9-fluorenilmetoxicarbonil) ligado ao grupo α-amino. O grupo Fmoc é uma porção protetora lábil em bases que é removida seletivamente sob condições básicas suaves (tipicamente piperidina em DMF), permitindo estratégias de desproteção ortogonais na síntese de peptídeos em fase sólida (SPPS).

Fmoc-Asn-OH (CAS 71989-16-7), também conhecido como Nα-Fmoc-L-asparagina, é um bloco de construção de aminoácidos protegido por Nα-Fmoc fundamental para a introdução de resíduos de asparagina na síntese de peptídeos em fase sólida baseada em Fmoc (SPPS). A molécula consiste no aminoácido L-asparagina com sua posição Nα protegida pelo grupo 9-fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) lábil à base, enquanto a cadeia lateral carboxamida permanece desprotegida.

Fmoc-Arg(Pmc)-OH (CAS 119831-72-0) é um derivado premium de arginina protegido por Nα-Fmoc apresentando o grupo protetor Pmc (2,2,5,7,8-pentametilcroman-6-sulfonil) na cadeia lateral do guanidínio. A molécula combina o grupo 9-fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) lábil à base para proteção Nα temporária durante a montagem da cadeia peptídica com o grupo Pmc lábil ao ácido que protege a funcionalidade guanidínio altamente reativa da arginina.

Fmoc-N-Me-Arg (Pbf) -OH (CAS 913733-27-4) é um derivado de arginina Nα-metilado protegido por Nα-Fmoc especializado apresentando o grupo protetor Pbf (2,2,4,6,7-pentametildihidrobenzofuran-5-sulfonil) lábil ao ácido na cadeia lateral do guanidínio. A molécula incorpora três elementos estruturais principais: o grupo 9-fluorenilmetiloxicarbonil (Fmoc) lábil à base para proteção temporária de Nα durante a montagem da cadeia peptídica, a metilação Nα que introduz restrição conformacional e aumenta a estabilidade metabólica na terapêutica peptídica, e o grupo guanidínio protegido por Pbf na cadeia lateral da arginina que evita reações colaterais indesejadas durante o acoplamento.